阿米巴菌原是一种引起阿米巴痢疾的寄生单细胞原生动物，它通常寄生在人的肠道和其它内脏中，但是对于科学家来说，它是一种有很高研究价值的微生物。简而言之，它是一种可以通过伪足运动前行，吞噬有机物的单细胞生物。
阿米巴痢疾严重威胁着人们的健康，而该病的发生率几乎与饮水卫生无关。通过对阿米巴菌的基因组测序、细胞形态及其代谢途径等方面的研究，科学家们探究了细胞吞噬、微管的重构和细胞粘附等生命活动规律，阐明了生命活动的内在机制，这对生命科学的研究有着重大贡献。
值得一提的是，近年来阿米巴菌的种类不断增多，如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、孢子链霉菌等，它们已被广泛应用于污染物的生物降解、有毒物质的清除和其他污染物治理等环境保护领域。
